(1)采取必要的政策保護措施：在該農田水利工程項目建設的過程中，需要以鄉鎮為單位進行組織施工。在統一規劃的基礎上進行建設，并根據統一標準實施獎補措施。對于施工技術含量較高、施工時間緊迫、施工任務沉重的工程，需要由水利局進行組織，安排專業化施工作業，按照國家相關的定額標準對工程進行結算。

(2)施工技術保障措施：該農田水利工程主要是由水利局組織建設的，工程設計以及監理工作都是由水利局組織進行的。另外環保局需要對灌區的環境保護效果進行監測，農業局則要對灌區糧食增產的實際效益進行監測，計劃部門通過總結上述監測結果做出最后的綜合評價。

(3)資金管理措施：在該農田水利工程建設中需要嚴格實施專戶管理，通過設置專戶儲存，做好財會工作，確保各種款項能夠用到專門的建設項目中。

(4)工程建設過程中的管理措施：在該農田水利工程建設中，需要進一步落實項目法人制，通過實施招投標制度確定合適的承包人，并利用施工合同嚴格規范各個施工方，規范組織施工，做好監督管理工作，防止出現豆腐渣工程。