在我國，興修水利工程對生態平衡以及環境的影響開始重視始于上個世紀五十年代后期。為此，國務院專門規定今后凡規劃大型(中型水利工程，必須同時要考慮到環保問題。

1、積極影晌

(1)跨流域調水工程會解決“調水地區”易遭洪水威脅的災害問題，挽救地區性生態危機。如：原蘇聯的北水南調等工程除工農業用水之外，還可緩解里海水位下降而引起的生態環境惡化。我國的南水北調工程，將會很好地緩解因南澇北旱所帶來的生態環境惡化問題。

(2)大型蓄水庫如我國的黃河小浪底工程既能防沙除澇，又能增加庫區空氣濕度，改善其周圍綠色植被的生長。如前蘇聯的中亞和哈薩克的沙漠，由于調入了大量的水，部分地區已變成繁茂的綠洲。

(3)優化水質，減少水污染和下游河道的泥沙淤積。

2、消極影響

(1)爝發地震。由于大量水體的聚集，會使庫區地殼結構的地應力發生變化，為誘發地震創造條件。

(2)輸水渠道兩岸由于滲漏，使地下水位抬高，造成大面積土壤次生鹽堿化、沼澤化。高邊坡地區還會因土壤含水過高而引起滑坡或泥石流。

(3)對調出水地區生態也有不利影響。如原蘇聯的北水南調工程造成原流入喀拉海的淡水量和熱量減少，西伯利亞大片森林遭破壞，風速加大、春雨減少、秋雨驟增，嚴重影響農業生態環境。

(4)打破了原有水系內生物(尤其是珍奇動物)的生活環境，嚴重的會造成滅絕，或打破了原有的生態平衡系統，使食物鏈遭到破壞，可能引起瘟疫等災難。如三峽庫區的猿猴，據專家預測，到三峽大壩建成后，會有相當數量猿猴流離失所，再也沒有“兩岸猿聲啼不住，輕舟已過萬重山”的盛景了。

(5)對生物、水文、水溫等其它不利影響。大型水利工程改變了原有水文條件，影響了地下水質和水溫，造成居民的遷徙、集中，加快城市擴展，導致可用耕地日趨減少。